Институт центральноазиатских исследований (CASI) - межведомственное исследовательское подразделение Американского университета Центральной Азии, созданное в 2011 году с миссией содействия изучению Центральной Азии на местном и международном уровнях.
Институт образования (IOE) является междисциплинарной академической единицей АУЦА, занимающейся преподаванием, исследованиями и пропагандой образования на всех уровнях и в транскультурных контекстах.
Президентский фонд исследований и образования (PREF) - это уникальная инициатива, направленная на поддержку отдельных проектов преподавателей, студентов и сотрудников для проведения исследований и образовательных мероприятий через Управление делами Президента AUCA. Фонд особенно приветствует начальное финансирование новых инициатив в университете, мультидисциплинарные проекты и проекты с участием студентов АУЦА.
ТАЦ проводит исследования по миграции, устойчивому развитию и защите окружающей среды, защите прав человека и демократическому управлению; организует семинары и конференции, посвященные важнейшим проблемам ЦА региона.